平腦症與產前全基因外顯子定序

林小姐(化名),曾經有個小孩,因為平腦症(lissencephaly),很小的時候就過世了,後來發現是TUBA1A基因異常的原因。

這事情帶給她相當的創傷,這次懷孕,她顯得相當焦慮。

一般而言,TUBA1A基因異常造成的平腦症是突變,不會傳給下一代,不過她一直擔心,會不會有其他問題 ?

這部分我不敢保證,因為過去的經驗告訴我,有時基因異常不只一個。

所以我答應她,用羊膜穿刺同時做了染色體檢查,羊水晶片及全基因外顯子定序。

結果正常,沒有TUBA1A基因異常,當然在全基因外顯子定序會看到一些在未來”可能”會影響健康的基因變異,不過沒大問題。

懷孕30多周發現,胎兒體重略輕,我推測是前置胎盤,影響臍帶血交換的關係。

應該是創傷經驗加民俗月的關係,她挑了一個特別的時間要剖腹產,我了解她的感受,就答應她。

日前出生了,胎兒正常且活力很好,一切都順利。

心理透過基因作用影響身體

心理對疾病的有相當大的重要性,那麼,心理狀態是如何影響身體的 ?

關鍵機制是透過基因作用。

心理狀態一般不會造成基因突變,但它主要會透過表觀遺傳(epigenetics)調節基因作用,包括免疫、神經及代謝系統細胞的基因,當這些系統失控時,疾病就形成。

在一篇Nature Communications (Tamar, 2018)研究中,發現刺激實驗鼠腦中情緒系統,會誘發免疫系統一連串的基因反應,讓腫瘤變小了一半。

當然現實生活中,常可以聽到有人因情緒上重大打擊,而發生癌症的消息,這些都是心理狀態影響身體的例子。

所以講基因體醫學或預防醫學,都要將心理納入考量,才會完整。

免疫系統失調是常見疾病重要原因

我分析很多複雜疾病(癌症、精神分裂、多囊性卵巢症候…)的基因體表現,發現基因作用異常影響病因比重最大的,幾乎都是免疫系統失調。

免疫系統就像是身體的執法單位,透過基因訊息行動,修正身體的異常,過與不及都對身體不好。

一個實際應用的例子 : 大腸癌腫瘤的免疫細胞與腫瘤抵抗力有關,可用Immunoscore (免疫評分) 計算 (如圖),免疫分數太低者,預後較不好,這方法具有相當的準確性,已被納入2020年歐洲醫學腫瘤學會(ESMO)大腸癌治療指引。

影響免疫功能的因素,主要是基因、後天及心理因素。

免疫基因可以用全基因定序檢查,免疫功能可以抽血檢查,項目繁多。

平常就應注意維持免疫功能平衡,別等免疫系統改變再補救,因為免疫細胞有記憶性。

自己可以做的,包括適當運動,充足的睡眠,注意飲食(避免高熱量高糖食物),調整心理狀態,以維持免疫功能平衡。

基因異常帶原的影響

有基因異常帶原,自己身體到底會不會有事 ?

基因隱性疾病帶原,一般說法是不會生病 ; 但是事實上,該基因功能會減弱,身體還是會受影響。 

典型的例子是地中海型貧血帶原,還是會輕微貧血症狀,許多人會以為是一般貧血,在沒確認身體真正異常情況下,補充過多鐵劑,造成細胞及器官不必要的負擔。

另一個相關的例子,HFE基因帶原,會影響鐵代謝,雖然不會有血鐵沉著症,但會增加失智 (阿茲海默症) 的機會 ; 這類病人不適合攝取過多鐵,例如綜合維他命(含鐵)、牛排等。

所以有些基因異常帶原與未來一些疾病有關 ; 找出這些帶原,其實是了解自己身體隱性缺陷,可以減少疾病的風險。

這部分是預防醫學被忽略的重點,因為我做全基因定序時發現各種的基因異常帶原其實蠻多的。

全基因定序分析系統

推廣基因體醫學 –基因是決定健康的核心元素,每個人基因變化都不同,善用基因體資訊,可以設計量身訂製最適合自己的健康規劃,讓醫療更精準。
這次婦產科醫學會有兩個演講的機會,我主要介紹我發展出的全基因定序分析系統。這系統串列多個不同的分析式以增加其準確度及廣度,列出所有致病性基因變異,並用多個過濾器篩選,用最新的資料庫比對,再由人工分析。


全基因定序分析要處裡巨量資料,有很多陷阱,所以一個嚴謹可靠的分析系統很重要。
目前我全基因定序分析做了80多例,根據分析可能的出錯的地方不斷修正這分析系統,我統計29個先天異常分析的案例,這系統針對先天異常致病基因偵測率達65.5%,比平均37.5% (BMC Medical Genomics 2018)更佳。
目前100%還不可能,因為許多基因變異還是未知。不過這部分我有對策 –> 一段時間後用最新的資料庫再次比對,因為目前新的基因資料增加速度越來越快,有機會找到答案。
有需要說明及演講的都歡迎告訴我,衷心期待有推廣的機會。