避免胎兒遺傳疾病的方法

日前接到一個血液染色體的急件,要我們趕緊幫忙確認一個剛出生寶寶的性別。

這個寶寶出生時發現外生殖器異常,即使兒科醫師也無法判定是男生或女生。 這情況馬上引發一連串的問題 : 到底寶寶生了什麼病 ? 還會有什麼異常及影響 ? 連出生證明都沒法寫。

我想最焦慮傷心的應該是父母親。

後來染色體報告出來了,是個女寶寶(46,XX)。同時,一系列的檢查顯示這寶寶得的是一種叫 ”先天性腎上腺增生” 的疾病,這是一種基因異常引起的隱性遺傳疾病,由於基因異常造成參與合成腎上腺皮質激素的酵素缺乏,可能會導致一些生長代謝,或是外生殖器的異常,就像這女寶寶有男性生殖器的外觀。

後來婦幼聯合會議討論到這案例,除了日後的治療之外,大家關心的重點,就是如何避免,或是在產前早期認出這問題,因為可以在懷孕中使用藥物,有機會減低胎兒疾病影響程度。

但實際上,懷孕中要做到早期辨認很難,因為常常無跡可尋,沒有家族病史,這媽媽之前產檢都正常,直到35周時超音波才看到寶寶外陰部有腫大(圖),但是這微弱的證據力也很難就直接能說是先天性腎上腺增生。

事實上,其他的人類基因遺傳疾病還有一萬多種,先天性腎上腺增生只是一個例子。

如何避免類似的情況 ? 我的建議是,最穩當有效的方法是,夫妻在懷孕前做全基因檢測配對,如果配對到將來胎兒有可能發生遺傳疾病時,抽羊水檢查確認有無基因異常即可。

精準預防醫學與慢性發炎狀態

林小姐(化名)近來飽受全身關節疼痛的的不適,她為此作了很多檢查,包括核磁共振,但都正常,僅抽血發現類風溼性關節炎因子輕微高於正常,但關節外觀上看來無變化,醫師告訴她應該沒事。

不過疼痛真的存在,為了怕有潛在問題,及更進一步了解自己的身體,她來我這作全基因檢測。

全基因檢測的報告出來後,下一步的工作是將她所有重要異常基因,與她的身體症狀、情緒心理狀態,及生活習慣進一步比對。

林小姐的症狀是在停經後變得明顯,似乎停經的情緒改變誘發了她的關節疼痛。

她的全基因檢測顯示,有好幾個免疫基因的變異(藍箭頭),代表她的免疫系統失衡,這可以由類風溼性關節炎因子輕微高於正常,及關節疼痛的症狀看出。

我告訴她這算是慢性發炎狀態。

慢性發炎狀態算是亞臨床異常,也就是,身體有輕微變化,但不到正式疾病的程度。

雖然不算疾病,作為一個基因及精準預防醫學的醫師,我相當重視慢性發炎狀態。

慢性發炎狀態是許多成人疾病的前驅,包括癌症、動脈硬化、失智或是自體免疫疾病,改善這種情況,可以避免許多疾病。

她問到,可不可以補充賀爾蒙治療 ? 我告訴她不適合,因為她有CCDC170基因變異 (紅箭頭),這會造成乳癌體質。

有了基因體資訊,我們有機會做到精準預防醫學,以及需要避免的醫療處置。

Lynch症候群(2) -年輕人的癌症

林女士(化名) 的先生才因為大腸癌過世…

她的大兒子不久前,身體也出了一些問題 ; 一開始是只是腹痛及拉肚子,但一直查不出原因,拖了一段時間之後,才發現竟然也是大腸癌,但已經太晚… 大兒子在僅僅21歲的時候,也過世了。

她帶著二兒子來我這裡檢查基因,她說,這是最後一個親人,不能再失去這唯一的小孩。

看著這對母子,原來一家四口,發生這變故,只剩下眼前兩人,聽來相當令人心酸,一定要好好幫助她們。

造成這家族性大腸癌 最有可能的原因,是我之前提到的Lynch症候群。這是一群負責修復基因的異常造成,但是因為先生及大兒子已經過世,無從證實,我只能檢查二兒子。

我私下希望二兒子的基因是正常的,不過分析一定要客觀,不能參雜個人喜好因素。

後來全基因檢測的報告出來了,結論是 : 大致正常。 

為何結論聽來有些保守呢 ? 這是因為我檢查的原則是盡可能完整不遺漏,在分析程式設計時,會並用多個variant calling algorithms串聯結果,所以一些QC較差,可能是假訊號的基因變異,也會出現在報告中。在二兒子的基因中,不巧就有一個與Lynch症候群有關的MSH2基因變異,由IGV的圖看來,只出現一個變化,我自己是推測這一個點應該是程式誤判,但為求慎重起見,我再送去做Sanger定序確認。

當然大兒子早點發現病因,結局應該會更好,只是21歲的年齡,讓人很難想到會有大腸癌。不過,做基因檢測的好處就是能提供方向 ; 如果事前先知道有Lynch症候群的基因,有腹部不適的症狀,就應該將大腸及其他腸胃道癌症納入檢查範圍,另外,體檢的時間應提早進行,以期早期治療。

有失智基因APOE 基因異常的人不算少

最近發現有APOE 基因異常的人還不少,我自己檢查過的人中,約15%有這情況。

看到有這基因異常,我都會再問一下膽固醇的情況,結果十之八九,年輕時膽固醇就過高。

這基因異常的特性,除了造成膽固醇高外,最大的問題,是與失智有關。

大部分都是rs429358這個位置單一變化(C;T)。研究顯示,這情況下,失智的機會變3倍,心臟病的機會是1.4倍,如果是雙重變化(C;C),失智的機會是12倍。

但好消息是,好好控制膽固醇,失智的機會就會降低。

在臨床上的重要性是,先天膽固醇高的原因很多,如果是APOE基因異常引起的,就要更注意,因為這可以精準預防未來的失智。 但高達15%人有這情況,不免令人擔心,不少人可能在不知情的情況,錯失了預防的良機。

台灣精準醫療計畫

報告大家一個好消息 –免費的基因檢測

這就是台灣精準醫療計畫 (TPMI)。

做這基因檢測有何用處呢 ? 現在生病的原因,或是未來可能會罹患的疾病,或是適合用哪種藥物,要不要調整劑量,答案常在自己的基因中。所以基因測的目的是提供精確的治療,或預防疾病方向。

現在醫療的趨勢,是依據由基因決定的體質來選擇最適合自己的治療方式,也就是個人化醫療,避免無效醫療或不必要的副作用,不再是過去一視同仁的制式治療。

這計畫是挑選近七十萬個的重要基因變異點進行定序分析,這些基因主要是華人常見疾病,例如癌症,或是藥物代謝基因有關,算是全面型的基因檢測,檢測結果不只可以看到自己的基因體質,這資料也對了解台灣本土基因變異特殊性有相當大的幫助。

與我常做的全基因外顯子檢測(WES)或全基因檢測(WGS)有何差別呢 ?

台灣精準醫療計畫相當於精簡型的全基因檢測。我這裡已經分析幾百個TPMI案例,實際了解其中的基因檢測內容後發現,TPM雖然較精簡,但也包含一些全基因外顯子檢測(WES)沒檢查到的地方,兩者其實有互補的作用。不論是全基因檢測或是TPMI,這些基因資料一輩子都用得到。

我這裡分析程式都已經設定完成,如果在台北榮總參加檢測,我就可以由原始數據進行深度分析,並完整詳細解釋其中基因變異需要注意的事項。

歡迎興趣了解自己的人來參加這檢測計畫。