來不及說明的報告

看完了林女士(化名)全部的基因密碼,閉上眼睛,彷彿她的一生由我眼前一閃而過。

當時被告知,有個卵巢癌的病人,要檢查基因。我到了病床邊,看到她瘦弱的身體及深陷緊閉的雙眼,滿頭亂髮的兒子守在一旁,我輕喊了一下她的名子,但沒反應,我大概瞭解是甚麼狀況,靜靜地退了出去。

基因分析報告在完成之前,她已經過世。

懷著一絲愧疚,我請她兒子來聽分析報告,他說不要介意,因為本來預期會有這情況。林女士生前堅持要完整檢查自己基因,是因為直覺知道自己健康有些需要注意的地方,她要將這訊息留給後代注意。

與林女士兒子言談之間,發現她的一生相當不平凡,兒子相當以母親為榮。她是個國內大型功德會的創會元老,一生都在默默行善,幫助過很多人。

全基因定序顯示同時有三個癌症基因 : PALB2、CCDC170及RAD51C。

我分析過不少卵巢癌患的基因,以林女士的情況而言,同時有三個癌症基因,但晚到七十歲才發病,算是相當不容易。我猜原因應該是,常常自發幫助他人,造就穩定詳和的心靈狀態,再加上對個人生活習慣的要求,讓身體各系統運作穩定,癌症不容易發生。

染色體上有個終端粒的構造,它的長度會隨時間流逝,慢慢變短,到一定長度時,人的壽命會到達終點。出生時就預設了死亡,是人生不可避免的定律,不過我相信,此生只是感官或科學儀器可以感知的一個階段的顯現,但是因為有死亡的存在,生命才顯得更可貴,隨時自己提醒此階段的時間並非無限,維持健康,在於有限的時間內完成自己。

不明原因的腫瘤指數升高,用全基因檢測找到了答案

45歲的黃先生其實蠻健康的,他被太太找過來一起做全基因檢測,作為精準預防醫學之用。

他們兩位都相當注重自己的健康,都會定時做體檢。做全基因檢測之前,我們都會仔細地將以前所有的健康問題都記錄下來,黃先生提到他有個未解的問題 : 腫瘤指數CA19-9之前曾高過,後來又降下來,做過許多檢查,都是正常。

不明原因腫瘤指數高是蠻讓人焦慮的一個情況,特別是CA19-9與胰臟癌有關,不過這只是眾多可能性之一,還有許多其他原因都會讓CA19-9升高,包括膽囊發炎。

全基因定序的報告完成後,我請他們來聽分析結果。全基因檢測比對資料庫後會列出不少致病性基因,透過我們自己累積的大量經驗再進一步過濾,最後,黃先生需要注意的基因是 : USP53,IL4R,NR0B2及HFE 這四個。(這次只講USP53這基因)

分析時還要仔細與症狀比對。

我 :「USP53這基因與膽…」

還沒說完,黃先生馬上問 :「與膽紅素有關,對不對 ? 我之前膽紅素也曾高過 」

我 :「腹部有沒有不舒服 ? 」

黃先生:「有,有時右上腹會痛」

問答之間,黃先生提供了之前未提到重要的線索 ; 腫瘤指數CA19-9升高的原因其實很明顯了。

其實USP53與膽汁鬱積有關,膽汁鬱積造成膽紅素異常,右上腹痛,及腫瘤指數CA19-9升高。

由黃先生症狀及過去影像檢查的結果來看,推測這屬於亞臨床症狀(subclinical),也就是輕微不到疾病的程度,對他的健康應該無影響。

每個人都有特別的體質,答案常常就藏在基因中。

基因大數據加人工智慧技術分析卵巢低惡性度腫瘤

大家都知道,腫瘤一般分為良性及惡性 ; 但卵巢腫瘤還有另一個常見、但較少人提及的分類,叫做’低惡性度腫瘤’(BOT,borderline ovarian tumor)。

卵巢低惡性度腫瘤常常會長很大,但奇怪的是,行為相當溫和,所以它以前被歸類為半惡性腫瘤,這種特性實在讓人很好奇,到底在分子基因層面發生什麼事,不過我查了文獻,發現以前幾乎沒人研究。

那就自己來分析 ; 要掌握一個疾病的核心,就要從它的基因變化研究開始。 我將過去資料庫中低惡性度腫瘤基因表現收集起來,進一步分析,一開始,只看基因表現較難具體看出這類腫瘤特性。後來我透過多基因資料轉換技術,將基因體轉換為功能體,這時它隱藏的秘密就現形,而且特性相當明確,可用人工智慧辨認,準確度接近100%。

我們同時發現低惡性度腫瘤在免疫、代謝及細胞生長調控發生異常,並由此找出不少重要的相關基因,這代表可以用基因表現透過人工智慧精確認出低惡性度腫瘤,並提供日後發展精準醫療的線索。

這研究發表到IJMS (International Journal of Molecular Sciences),很罕見的,評審沒刁難,僅要求minor revision,要特別感謝三總的蘇國銘醫師,他出力最多。

乳癌與PMS2基因異常

24歲的李小姐的母親是乳癌患者,為此她幫自己做了基因檢測,報告顯示有PMS2基因變異。

忐忑不安的李小姐拿報告來我這裡,問我該如何是好…

因為外面做的基因檢測良莠不齊,我第一步會先透過資料庫,查這基因變異點的”證據力”,也就是可信程度。

提出這PMS2基因變異 -NM_000535.7(PMS2):c.746_753del (p.Asp249fs)的報告只有一個,屬於致病性變異(pathogenic),雖然是證據力較弱,但我評估,這PMS2基因變異仍須特別注意。

下一步就是安排檢查 ; 這變異會造成基因修復異常,也就是Lynch syndrome,主要造成大腸癌,其他如生殖道、乳房都是需要檢查的地方。

後來乳房超音波報告出來了 : 發現有個一公分的病灶,懷疑是惡性腫瘤(category 4) ; 其實,我看到這報告,也是嚇了一跳,不知道如何向她解釋。

為了完整治療療程,我請一位乳房醫學專家幫忙,慶幸的是,後來切片報告是良性變化,鬆了一口氣。

目前乳癌有年輕化趨勢,乳癌有相當部分是屬於基因遺傳性的 ; 一般而言,乳癌越年輕發病,基因佔的因素越大。最有名的是BRCA基因,就如我上篇寫的故事。 

早點做基因檢測是好的,因為有警訊,才會更有心去預防及經營身體健康。

我們的目標是預防,或是早期發現及處裡,只要是癌症,早期處裡的效果都很好。

如何預防或減少乳癌呢 ?

1. 保持體重

2. 多運動

3. 多吃青菜水果,避免喝太多酒

4. 不抽菸

5. 餵母乳

6. 避免用避孕藥

7. 避免使用賀爾蒙製劑

8. 使用藥物

有個病人告訴我,她覺得乳癌是”情緒”的疾病,我相當認同,情緒壓力與癌症有很大的關係 ; 預防癌症,要做好壓力及情緒調整,有困難不妨找醫師幫忙。  

以上,對於帶有乳癌基因變異的人,特別重要。

其他就是定期檢查,這部分讓我們來幫忙安排就好了。

遺傳性乳癌基因 -BRCA2

20歲的林小妹妹來做全基因檢測 –因為媽媽在50歲時罹患乳癌,查出是BRCA2基因變異,擔心會遺傳給女兒。

結果出來了 : 林小妹妹身上確定有與媽媽一樣的BRCA2基因變異

BRCA基因(BRCA1,BRCA2)可能是大家最熟悉的基因。演員安潔莉娜裘莉家族中有不少人因為有BRCA1基因異常罹患乳癌,她做了基因檢測,確定自己也有BRCA1基因異常後,毅然接受手術,將乳房及卵巢都切除,預防未來可能的癌症發生。

是不是要做這種預防性手術,看法因人而異,不過近年已經有許多效果優異的標靶藥,可以有效控制因BRCA基因異常引起的癌症,也許安潔莉娜裘莉知道這事後,會改變她當初的決定。

有BRCA2基因變異,一輩子約有一半機會會有乳癌,這機會不算低,不過也代表約有一半的人不會發病 ; 不會罹癌的原因,包括身上是否有其他癌症基因,及後天因素包括生活習慣、飲食及心理等,這些是精準預防乳癌要注意及調整的重點。

目前做全基因檢測,檢查全部兩萬多的基因的費用,與單查BRCA1/BRCA2兩個基因費用差不多,我們當然是建議做全基因檢測,這樣我可以整體評估林小妹妹的狀況。由全基因檢測的結果看來,妹妹的其他基因沒特別問題,相信她是不會發病的50%那一群。

不過她有GHRL基因變異,容易有過度飲食的傾向,站在精準預防乳癌的角度,飲酒、高脂肪及含荷爾蒙的食物要避免。

當然,需要定期追蹤。目的是早期發現及處裡,效果極佳。早點做基因檢查是好事,因為一般人不會想到在20歲時就去檢查乳房,常常發現時已經是晚期,治療效果已經差很多。此外,BRCA基因會引起其他部位的癌症,包括卵巢及胰臟等,都是檢查重點。

我們也發現她有聽障基因GJB2的帶原,這基因在台灣帶原率很高,建議她未來的先生要檢查,或是她懷孕時再確認胎兒是否有異常。

林小妹妹您不用擔心,往後的健康照護,我們會幫您安排及注意。

年輕人的家族性高膽固醇症

剛剛看到令人難過的新聞 : 41歲藝人表演時叫不醒!死因竟是高膽固醇血症造成心因性休克

大部分年輕人的膽固醇都不會太高,所以壓根不會想到去檢查自己的代謝情況,其實健保也不給付。

事實上,有一部分人年輕時的膽固醇就相當高,這情況常常是基因異常所造成,例如LDLR、APOB、APOE、PCSK9….等,也就是所謂的家族性高膽固醇症。

但是我分析基因的病人中,其實看到不少人有先天膽固醇代謝基因的異常,而病人常常不知道自己有膽固醇高的現象,直到我幫他們抽血才發現,這現象讓我有點擔心。

膽固醇高不會馬上有症狀,但時間久了,造成血管阻塞,嚴重時會發生心臟病或中風。

家族性高膽固醇症不算少見,慢慢造成傷害,像是隱形殺手。 站在精準預防醫學的角度,我是建議,年輕時就先檢查自己的基因體,針對潛在疾病,做好健康規劃,如果有家族性高膽固醇症,只要有自覺的話,其實是可以早期處裡,將傷害降到最低的疾病。

許多癌症是被誘發出來的

陳昇得到口腔癌,達叔是肝癌。

癌症可以更有效的預防嗎 ?

實際上,許多癌症是被誘發出來的,先有癌症體質,再加上環境因素造成。

口腔癌常是因抽菸喝酒嚼檳榔誘發的。

有人可能會問,許多人一輩子抽菸喝酒嚼檳榔都沒事,差別在哪裡 ? 癌症體質如何檢查 ?

答案是基因,例如口腔癌與TP53、MSH等先天基因異常有關。

其實,每天都有許多DNA突變發生,正常情況下,細胞會自行修復這些突變 ;但有些人身上有先天癌症基因,造成修復能力會下降,再加上抽菸喝酒嚼檳榔這些致癌物,增加突變機會,身體修復不及,特別是發生在調控細胞生長的基因突變,讓細胞生長失去控制,癌症就形成了。

現在,可以利用精準預防醫療技術 : 先完整檢查基因,了解自己的弱點,做好個人化健康規畫,如果發現有先天癌症基因的人,就需要嚴格避免菸酒檳榔這些致癌物,並將好發癌症部位做為體檢重點。

就像導航一樣,事先知道自己的弱點在哪裡,有防範的方向,遵守必要的原則,可以更精準地避開癌症等常見疾病。

產前全基因檢測

基因體的資料,有可能幫到肚子裡的小生命。

王小姐(化名),懷孕早期就發現,胎兒頸後透帶增厚,她做了羊膜穿刺,加上羊水晶片檢查染色體,結果都正常。

胎兒有異常,但染色體檢查正常,這代表甚麼 ?

頸後透明帶增厚,一般都會先做染色體檢查,但老實說,染色體正常,不代表就沒事,因為也有可能是基因異常,例如努南氏症,只是以前技術無法快速檢查所有基因的關係,所以產前全基因檢測沒人做。

王小姐來我這裡時,已經懷孕22周多,胎兒頸後透明帶厚度是5.6公厘,相當明顯,數字看來不太樂觀。

我建議她做trio 全基因外顯子定序 (父-母-胎兒),因為週數相當逼近台灣法定可終止懷孕的週數期限24周,需要用超急件的方式,快一點確認胎兒基因有無異常。

三個人的全基因定序在7天多就完成,接下來我的電腦接力將原始資料進行解析,第九天時就完成三人基因體的分析,我們請夫妻兩人來聽報告。

好消息是,胎兒的基因體沒太大問題,決定繼續懷孕。

前幾天王小姐生了,經過兒科醫師仔細檢查,寶寶很健康,頸部後面稍微有些腫大,就如我們預測的一樣,應該是局部淋巴系統生長不良的關係,對健康無礙。

任務解除,恭喜他們。

目前,胎兒有異常,除了染色體檢查,建議完整基因體一併檢查,這樣可以有更充足的資訊,做更正確的決定。

癌症發生的故事

這次由基因、心理及人生的角度,完整的講一下癌症發生的故事。

林女士有家族癌症史,本來就容易焦慮、沮喪。她還有高血脂的異常,服藥控制中 ; 她已知是蠶豆症帶原。

幾年前再因為停經症候,及小孩升學問題,讓她情緒困擾更嚴重,後來父親罹患大腸癌,為了父親的病情,她心裡承受極大壓力。

接著沒多久,她就發生停經後異常出血,切片檢查後發現是子宮內膜癌。

她接受手術,同時來我這做全基因檢測,加上腫瘤突變分析,希望了解罹癌的始末,及標靶藥物治療的選項。

全基因定序發現是先天PALB2基因變異,腫瘤中發現有PTEN,PIK3CA後天突變。

這樣,我看到上下游的變化,癌症發生的經過就很清楚了。PALB2基因異常是出生後就有的,造成她基因突變修復能力下降,接者子宮內膜細胞累積後天PTEN及PIK3CA基因突變,造成細胞生長不受控制,變成腫瘤。

好在PTEN及PIK3CA基因突變造成的癌症屬於第一型子宮內膜癌,預後較好。

每天,身體都會有許多突變及癌細胞發生,不過身體系統會自行修復,但是,後天的因素,例如不當飲食,或心理壓力的加入,會讓這修復系統負荷過大而失效。

我這裡看到許多類似的案例 : 自己帶有癌症基因,加上重大壓力,接者,癌症就發生了。

她有SLC6A4基因變異,這會造成血清素代謝異常,讓她容易焦慮想不開,心理壓力變得更嚴重,加速癌細胞生長。

我常在想,這類病患,若是事前服用情緒調節藥物幫忙,可能可以減少癌症發生機會,當然,遇到重大壓力時,更應注意自己身體的檢查,這裡,我都可以幫忙。

其實,性格敏感不一定就不好,她發現停經後出血,且帶有異常腥味,讓她提高警覺,馬上來醫院檢查。我安慰她說,好在她夠個性夠纖細,很多人可能不當一回事 ; 林女士因為發現得早,開刀後確認是子宮內膜癌最早期,預後最好。

另外她有LRP1及APOE基因變異,會造成高膽固醇高血脂症,及CCL2基因變異,會容易動脈硬化 ; 特別是APOE基因變異,與失智症有關 ; 此外,高膽固醇高血脂症會有助癌細胞生長,膽固醇血脂更要好好控制。由此可以看出,身體是一個系統,要維持身體健康,系統中的相關元素都要顧到,效果才會更好。

基因異常所造成的焦慮體質

容易焦慮,想不開的的心理狀態,可能是基因異常所造成的體質。

林女士(化名),本來就容易焦慮、沮喪,幾年前再因為停經症候,及小孩升學問題,讓她情緒困擾更嚴重。

那時她有短時間使用賀爾蒙補充療法,情況有部分改善。

幾年之後,她因為子宮內膜癌來我這做全基因檢測,(癌症基因的故事,有機會再說),發現SLC6A4基因有雙重變異(homozygous)。

這基因負責血清素代謝 ; 血清素與情緒有密切相關,異常時會造成情緒問題,例如焦慮、抑鬱,或強迫行為。

這檢查結果代表她因為先天基因異常的關係,血清素代謝不佳,讓她容易焦慮想不開。

她回想,過去曾吃了一種名為M的藥,效果很好,晚上睡很熟,但因為害怕上癮,就不敢再吃了。

M錠是血清素調節劑,她吃了有效,代表她的情緒問題與血清素關係密切,正好誤打誤著。

我告訴她,其實血清素調節劑不會上癮,她的情況正是血清素代謝不佳引起的,M錠是適合她的藥。另外,平常也可多補充些有益血清素製造的食物,例如香蕉。 容易焦慮,不一定都是個性想法引起的,有時是基因體質的關係,這時,可以透過基因檢查,確認原因,處理方向會更明確。