精準預防醫學與慢性發炎狀態

林小姐(化名)近來飽受全身關節疼痛的的不適,她為此作了很多檢查,包括核磁共振,但都正常,僅抽血發現類風溼性關節炎因子輕微高於正常,但關節外觀上看來無變化,醫師告訴她應該沒事。

不過疼痛真的存在,為了怕有潛在問題,及更進一步了解自己的身體,她來我這作全基因檢測。

全基因檢測的報告出來後,下一步的工作是將她所有重要異常基因,與她的身體症狀、情緒心理狀態,及生活習慣進一步比對。

林小姐的症狀是在停經後變得明顯,似乎停經的情緒改變誘發了她的關節疼痛。

她的全基因檢測顯示,有好幾個免疫基因的變異(藍箭頭),代表她的免疫系統失衡,這可以由類風溼性關節炎因子輕微高於正常,及關節疼痛的症狀看出。

我告訴她這算是慢性發炎狀態。

慢性發炎狀態算是亞臨床異常,也就是,身體有輕微變化,但不到正式疾病的程度。

雖然不算疾病,作為一個基因及精準預防醫學的醫師,我相當重視慢性發炎狀態。

慢性發炎狀態是許多成人疾病的前驅,包括癌症、動脈硬化、失智或是自體免疫疾病,改善這種情況,可以避免許多疾病。

她問到,可不可以補充賀爾蒙治療 ? 我告訴她不適合,因為她有CCDC170基因變異 (紅箭頭),這會造成乳癌體質。

有了基因體資訊,我們有機會做到精準預防醫學,以及需要避免的醫療處置。

Lynch症候群(2) -年輕人的癌症

林女士(化名) 的先生才因為大腸癌過世…

她的大兒子不久前,身體也出了一些問題 ; 一開始是只是腹痛及拉肚子,但一直查不出原因,拖了一段時間之後,才發現竟然也是大腸癌,但已經太晚… 大兒子在僅僅21歲的時候,也過世了。

她帶著二兒子來我這裡檢查基因,她說,這是最後一個親人,不能再失去這唯一的小孩。

看著這對母子,原來一家四口,發生這變故,只剩下眼前兩人,聽來相當令人心酸,一定要好好幫助她們。

造成這家族性大腸癌 最有可能的原因,是我之前提到的Lynch症候群。這是一群負責修復基因的異常造成,但是因為先生及大兒子已經過世,無從證實,我只能檢查二兒子。

我私下希望二兒子的基因是正常的,不過分析一定要客觀,不能參雜個人喜好因素。

後來全基因檢測的報告出來了,結論是 : 大致正常。 

為何結論聽來有些保守呢 ? 這是因為我檢查的原則是盡可能完整不遺漏,在分析程式設計時,會並用多個variant calling algorithms串聯結果,所以一些QC較差,可能是假訊號的基因變異,也會出現在報告中。在二兒子的基因中,不巧就有一個與Lynch症候群有關的MSH2基因變異,由IGV的圖看來,只出現一個變化,我自己是推測這一個點應該是程式誤判,但為求慎重起見,我再送去做Sanger定序確認。

當然大兒子早點發現病因,結局應該會更好,只是21歲的年齡,讓人很難想到會有大腸癌。不過,做基因檢測的好處就是能提供方向 ; 如果事前先知道有Lynch症候群的基因,有腹部不適的症狀,就應該將大腸及其他腸胃道癌症納入檢查範圍,另外,體檢的時間應提早進行,以期早期治療。

有失智基因APOE 基因異常的人不算少

最近發現有APOE 基因異常的人還不少,我自己檢查過的人中,約15%有這情況。

看到有這基因異常,我都會再問一下膽固醇的情況,結果十之八九,年輕時膽固醇就過高。

這基因異常的特性,除了造成膽固醇高外,最大的問題,是與失智有關。

大部分都是rs429358這個位置單一變化(C;T)。研究顯示,這情況下,失智的機會變3倍,心臟病的機會是1.4倍,如果是雙重變化(C;C),失智的機會是12倍。

但好消息是,好好控制膽固醇,失智的機會就會降低。

在臨床上的重要性是,先天膽固醇高的原因很多,如果是APOE基因異常引起的,就要更注意,因為這可以精準預防未來的失智。 但高達15%人有這情況,不免令人擔心,不少人可能在不知情的情況,錯失了預防的良機。

台灣精準醫療計畫

報告大家一個好消息 –免費的基因檢測

這就是台灣精準醫療計畫 (TPMI)。

做這基因檢測有何用處呢 ? 現在生病的原因,或是未來可能會罹患的疾病,或是適合用哪種藥物,要不要調整劑量,答案常在自己的基因中。所以基因測的目的是提供精確的治療,或預防疾病方向。

現在醫療的趨勢,是依據由基因決定的體質來選擇最適合自己的治療方式,也就是個人化醫療,避免無效醫療或不必要的副作用,不再是過去一視同仁的制式治療。

這計畫是挑選近七十萬個的重要基因變異點進行定序分析,這些基因主要是華人常見疾病,例如癌症,或是藥物代謝基因有關,算是全面型的基因檢測,檢測結果不只可以看到自己的基因體質,這資料也對了解台灣本土基因變異特殊性有相當大的幫助。

與我常做的全基因外顯子檢測(WES)或全基因檢測(WGS)有何差別呢 ?

台灣精準醫療計畫相當於精簡型的全基因檢測。我這裡已經分析幾百個TPMI案例,實際了解其中的基因檢測內容後發現,TPM雖然較精簡,但也包含一些全基因外顯子檢測(WES)沒檢查到的地方,兩者其實有互補的作用。不論是全基因檢測或是TPMI,這些基因資料一輩子都用得到。

我這裡分析程式都已經設定完成,如果在台北榮總參加檢測,我就可以由原始數據進行深度分析,並完整詳細解釋其中基因變異需要注意的事項。

歡迎興趣了解自己的人來參加這檢測計畫。

家族遺傳性癌症 -Lynch症候群

林小姐(化名)家族中有許多親人,都罹患癌症,主要是大腸癌。

她後來也逃不過這魔咒,罹患了乳癌及子宮內膜癌。 

不過由外表看不出她是個雙重癌症的病患,這是因為家族病史的關係,讓她更加小心規則追蹤,所以乳癌及子宮內膜癌都是相當早期時就處理了,對身體影響不大。

為了解開這魔咒的來源,她來我這做全基因檢測,報告顯示,是MSH2基因出了問題。

這基因會造成 Lynch 症候群 ; 這是由於一群DNA錯配修復基因的突變所導致,會較容易導致多種癌症的發展,包括大腸癌、子宮內膜癌、卵巢癌等。

大約300個人中有一人有Lynch症候群,其實不算少。

若身上有這些基因的突變,也不用過於驚慌。癌症除了預防之外,最重要的就是與醫師配合,早期發現並處理,就像林小姐一樣之後仍可以維持相當好的生活品質,生活不受影響。

夫妻都有聽力障礙,會不會遺傳給下一代 ?

林先生與陳小姐(化名)是夫妻,兩位看起來都相當正常,直到與他們交談時,才發現兩位都有聽力障礙的問題。

他們準備要懷孕了,擔心下一代一樣會有聽力障礙的異常,來我這裡做檢查。

聽障的原因可以分為先天基因異常及後天因素,先天基因異常會遺傳 ; 後天因素引起的聽障不會遺傳,若要預測下一代會不會有聽障,要檢查及比對雙方的基因。

陳小姐的全基因檢測結果,顯示有兩個不同的GJB2基因異常點,這是她聽障的原因。林先生的全基因檢測並沒有聽障基因異常,代表他應該是後天因素造成的聽力受損。

基因檢測的結果與與他們兩位發病的進展相符。陳小姐自出生就有聽障,而且聽力異常較先生嚴重 ; 而林先生在三歲以前,聽力是正常的,後來因為發燒,之後才發生聽障。他在動手術裝置電子耳之後,聽力就恢復相當不錯。

好消息是,由這結果來預測,他們的下一代,將不會有先天聽障的問題。

基因體醫學的用處

大家聽到基因體醫學,可能第一印象是一個與研究有關的學問。

其實基因體醫學不僅檢查基因,還要利用這基因資訊促進健康,也就是利用每個人特有的基因資訊,量身訂製最適合的健康規畫或疾病治療,做到精準-預防-個人化醫療,相較於治療晚期疾病,基因體醫學更強調預防,這是一輩子的工作。

日前在準備向院方(北榮)會議報告世界上重要醫學中心基因體醫學的現況時,瀏覽到美國麻省總醫院基因體醫學中心 (Massachusetts General Hospital Center for Genomic Medicine) -這應該世界最大的基因體醫學中心,他們的首頁,放了一個病人的普通故事,說明如何透過基因檢查,以避免心臟病風險,利用這故事,正好給大家了解,基因體醫學在做什麼。

(原文見 https://cgm.massgeneral.org/genetic-testing-assess-risk-heart-attack/ )

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Jessie 是一位 28 歲的媽媽和心臟科護士,患有家族性高膽固醇血症。家族性高膽固醇血症與基因有關,每 200 人中就有 1 人患病,如果不進行治療,患者在年輕時心臟病發作的風險會增加約 10-15 倍。但是早期識別、基因檢測、用藥物控制膽固醇和家族的篩檢可以有效降低這種風險。

其實Jessie 的父親在40歲出頭時就因高膽固醇血症造成心臟病發作。隨著 Jessie 開始有了自己的家庭,她開始擔心會不會有早發性心臟病的可能。

Jessie知道麻省總醫院基因體醫學中心可以幫忙。臨床遺傳科Natarajan醫師為 Jessie 提供了基因檢測和諮詢服務。測試的結果證實Jessie有家族性高膽固醇血症基因異常。這結果代表她兩歲的兒子有50%的可能性也帶有該基因突變。後來基因檢測結果證實的確也是有基因異常,看來,這基因影響了Jessie家族的三代人。現在Jessie懷孕了,有了另一個孩子,Jessie和她的丈夫現在明確表示,他們的第二個孩子也將接受篩查。

Natarajan醫師為 Jessie 擬定個人化的治療計劃,因為Jessie懷孕的關係,建議使用PCSK9 抑製劑(一種單株抗體),目的是可以充分降低她的膽固醇而不會影響她的胎兒的藥物。

Jessie和她兒子將繼續在麻省總醫院基因體醫學中心接受最好的基因體醫學照護,預防心臟病風險。

利用婚前基因配對避免重大遺傳疾病

許多先天重大疾病發生的原因,是夫妻帶有隱性基因,當受孕時,來自夫妻兩個異常基因碰在一起,會產生胎兒的疾病,可能成為生命中不可承受之重。

隱性疾病的特色是,自己不會有症狀,產前超音波也常常看不到異常,所以難以預測。

這情況,目前可以用婚前基因配對來排除 ; 做法是,用全基因定序,將先生太太的基因全部列出,配對比對,就可以看出有哪些胎兒可能會發生的疾病。

之前我做過相當多對夫妻的檢測,結果大致都正常,不過,最近一對夫妻發現了問題,非常巧合的,他們兩人都帶有罕見的ETFDH基因異常,這基因會造成細胞粒線體電子傳遞鏈出問題,形成一種稱為”多發性醯基輔酶A去氫酶缺乏症”(multiple acyl-CoA dehydrogenase deficiency)的疾病,在嬰兒身上會發生多重異常,問題會相當嚴重。

因為是帶原,自己都很正常,正要準備懷孕,才來做檢查,這情況下,將來懷孕胎兒發生異常的機會是1/4 ; 要如何預防呢 ? 做羊膜穿刺檢查胎兒基因就可以了。

當然這檢查,也會看到夫妻自己需要注意的問題。我發現太太有雙重GHRL基因變異,這會容易造成肥胖及代謝症候群,其實她家族已經有多人罹心臟病了,不過這是可以預防的,適當控制食量,就會有很好的效果。

視力減退的基因異常 – 視網膜色素病變

25歲的李小姐(化名),最近被視力減退所困擾。

李小姐看了很多家醫院,都查不出原因,後來在北部一家醫學中心,做了特別檢查後,才發現是視網膜色素病變(Retinitis pigmentosa)。

這疾病會造成視網膜細胞異常 ; 最先會出現夜盲,接著慢慢出現週邊視野縮小、明暗對比或顏色的分辨能力逐漸喪失等等。

李小姐知道視網膜色素病變可能與基因有關,她與姊姊來我這裡做基因檢查 ; 姊姊一起來還有個另外的原因。

我們建議用全基因檢測,這檢查會將一個人身上所有致病性基因變異全部列出來,比對最新的資料庫後,會看到現在生病的原因,以及將來可能會遇到的疾病。

報告明確顯示她是因為SNRNP200基因變異造成的視網膜色素病變第33型 ; 這基因與RNA剪接有關。

不只是SNRNP200,全基因檢測同時發現另一個視網膜色素病變基因變異 -RPGR。

完整列出所有基因異常很重要 ; 姊姊來的原因是她現在懷孕10多周,希望我們同時要檢查胎兒,是不是有視網膜色素病變遺傳的可能性 ; 雖然推斷應該無影響,但為了小心起見,姊姊後來還是檢測了SNRNP200及PRGR這兩個基因。

不幸的是,視網膜色素病變目前還無藥可治,嚴重時會失明,但每個人差異極大。視力的好壞實際由許多因素組成,例如近視、閃光、老花、黃斑部病變….   現在人3C設備使用量極大,對視力有直接的傷害,有視網膜色素病變的病人,應更小心保護視力才行。

落髮的原因

在分析蔡小姐(化名)全基因檢測時,我發現她有個特別的BTD基因異常帶原 ;   她曾提到為落髮及皮膚變差的問題所困擾,其實這幾者之間有巧妙的關係。

為了日漸稀疏的頭髮,她吃了十個月的柔沛,幫助生髮。

有效是有效,但毛髮長到不該長的地方,特別是臉部及身體。

連她的女兒都說 : “媽,妳看起來好像猩猩”

後來她再花錢做雷射除毛。

BTD基因異常會造成生物素(biotin,又稱維生素H、維生素B₇)缺乏 ; 生物素與毛髮生長有關,缺乏時會造成落髮或脂漏性皮膚炎。蔡小姐落髮及皮膚變差的症狀,其實應該是生物素缺乏的關係,我建議她補充生物素,這是健康食品,不難買。

雖然落髮不是她這次做全基因檢測的目的,但全部的基因都列出來時,這些資料常會揭露一些身體的變化的原因,讓人想都想不到。

體質的秘密就藏在基因中 ; 每個人體質都不同,了解自己的基因,可以更精確解決身體的異常。